Nella città di Den City, dieci anni dopo la creazione della realtà virtuale Link Vrains a opera della società "SOL Technologies", Yusaku Fujiki combatte per conoscere la verità su un incidente accaduto in passato. Eppure Yusaku odia essere al centro dell’attenzione, così a scuola fa di tutto per passare inosservato. Attraverso i duelli, però, dovrà incontrare altre persone e lasciare il suo ovattato mondo d’auto-isolamento. Yusaku possiede una mente brillante e le doti di un buon hacker; sa analizzare con accuratezza la situazione in ogni luogo, nonché anticipare pensieri e intenzioni dei suoi interlocutori. Il mostro che lo accompagna è denominato Decode Talker ed è dotato di una spada gigante. Sotto lo pseudonimo di "Playmaker", Yusaku si tuffa in una spirale di duelli che lo porteranno indietro nel tempo.
