The Boys si svolge in un mondo in cui i supereroi abbracciano il lato oscuro della loro massiccia celebrità e fama, diventando di fatto supercattivi. Un gruppo di vigilanti (conosciuti informalmente come "i Ragazzi") si propone di abbattere gli "eroi" corrotti.

Natsuki Subaru, un normale studente delle superiori, sta tornando a casa dopo aver fatto la spesa quando si ritrova catapultato in un altro mondo. Il ragazzo è confuso e si è perso in un mondo di cui non sa nulla; l'unica persona che lo tratta con gentilezza è una bellissima ragazza con i capelli argento. Determinato a ripagarla per averlo salvato dalla sua disperazione, Subaru accetta di aiutarla a ritrovare l'oggetto che sta cercando.

L’insegnante di scienze Ryland Grace si sveglia su un’astronave, lontano da casa di anni luce, senza alcun ricordo di chi sia o di come sia arrivato lì. Con il riaffiorare della memoria, torna alla luce lo scopo della sua missione: risolvere l’enigma della misteriosa sostanza che sta causando il collasso del Sole. Dovrà fare affidamento sia sulle sue conoscenze scientifiche sia sulle sue capacità di pensare fuori dagli schemi per salvare dall’estinzione la vita sulla Terra… ma un’inaspettata amicizia gli farà capire che non è solo in questa impresa.

Ambientata alcuni anni dopo la conclusione della serie madre, la vicenda segue la storia di Agnes, giovane figlia di comandanti, Zia Lydia, la direttrice della scuola per mogli e ancelle, e Daisy, una "ragazza perla", all'interno dello stato dittatoriale di Gilead.

Dopo una perdita devastante, la famiglia di Jake e Neytiri affronta una tribù ostile dei Na'vi, gli Ash, guidata dallo spietato Varang, mentre i conflitti a Pandora si intensificano ed emergono nuovi dilemmi morali.